| 課室名稱 |
業務內容 |
| 規劃課 |
掌理河川治理、排水改善、海岸防護計畫等事項，流域之整體治理規劃事項，各項水文觀測事項，其他臨時交辦事項。 |
| 工務課 |
掌理河海堤工程之勘測、設計、工務行政及監工等事項、防汛材料之製作與管理，其他臨時交辦事項。 |
| 管理課 |
掌理河(海)防建造物維護管理，河川、海堤管理、公地種植案件、砂石採取案件、一般申請案件、區域違法案件處理等事項。 |
| 資產課 |
掌理工程用地取得、資訊規劃及推動與管理維護。 |
| 秘書室 |
掌理文書、檔案、事務、出納、財物管理、研考及不屬於其他各課室之事項等。 |
| 會計室 |
依法辦理會計、統計及決算編報等事項。 |
| 人事室 |
依法辦理有關人事行政各項業務。 |
| 政風室 |
依法辦理有關政風事項。 |